La gestion financière des coopératives scolaires se situe à 2 niveaux : la coopérative de classe et la coopérative d'école. Ces 2 structures sont complémentaires, la coopérative d'école fédérant les coopératives de classe. 

La coopératove de classe 

La coopérative de classe est basée sur la gestion d'un budget pour un projet coopérative de classe par les élèves chaque l'âge, la maturité le permet. Cette gestion peut s'animer sous forme d'un conseil de coopération. Elle tend ainsi vers des apprentissages pédagogiques et démocratiques. Les idées de projets des élèves et de l'enseignant sont partagées, négociées et décidées. Cette gestion se réalise à l'aide d'un cahier de comptabilité. Elle est en lien avec la coopérative de l'école. En fin d'année, l'argent restant est reversé à la coopérative de l'école et le bilan de la classe sera intégré au bilan général de l'école.

La coopérative de l'école 

La coopérative de l'école gère les finances des projets coopératifs de l'ensemble de l'école. Elle ne se substitue pas aux financements des collectivités locales.La gestion est assurée par des délégués de classe, des enseignants auxquels peuvent être associés des parents.

L'OCCE 70 propose le fichier coopscol pour gérer la comptabilité de la coopérative de l'école (voir espace mandataire).

Chaque année, un compte rendu financier et d'activités fait apparaître le compte de résultat et le bilan. Il est approuvé et signé par au moins 2 vérificateurs aux comptes, enseignants ou parents extérieurs à la gestion des comptes afin de valider la régularité et la bonne tenue des comptes.